《食品安全國家標準 食品用菌種安全性評價程序》（GB 31615.2-2025）是首次制定的標準，旨在為食品用菌種提供一套系統、科學的安全性評價程序。標準規定了食品用菌種(包括細菌、放線菌、絲狀真菌、酵母及單細胞藻類)的安全性評價程序。適用于食品、食品添加劑用活的微生物菌種(包括細菌、放線菌、絲狀真菌、酵母及單細胞藻類)的安全性評價。不適用于遺傳修飾微生物的安全性評價。

本標準規定了擬評價微生物菌種的基本資料要求，提出了擬評價微生物菌種評價方法，包括國內外安全性評價資料分析，基于全基因組測序數據的毒力基因、耐藥基因、毒素產生相關基因綜合分析，動物致病性、耐藥性、產毒和毒理學試驗，以及其他活性物質測定等，并提供了附錄參考方法，來綜合評價食品用菌種的安全性。

這一系列措施不僅提升了對食品用菌種安全性的把控，也為行業提供了統一的操作指南，有助于規范市場秩序，增強消費者信心。