本標準為首次制定的標準，規定了食品用菌種（包括細菌、放線菌、絲狀真菌、酵母及單細胞藻類）的安全性評價程序；適用于食品、食品添加劑用活的微生物菌種（包括細菌、絲狀真菌、酵母、放線菌及單細胞藻類）的安全性評價，不適用于基因改造微生物的安全性評價。

本標準規定了擬評價微生物菌種的基本資料要求，提出了擬評價微生物菌種評價方法，包括國內外安全性評價資料分析，基于全基因組測序數據的毒力基因、耐藥基因、毒素產生相關基因綜合分析，動物致病性、耐藥性、產毒和毒理學試驗，以及其他活性物質測定等，并提供了附錄參考方法，來綜合評價食品用菌種的安全性。 

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